墓地小教堂重建于十八世纪下半叶，靠着圣器室管理副手墙。大内院的部分院子用作墓地。以前把教士的尸体抬到小教堂按照惯例的规定(由修道院第五位院长Guigues制定，里面描写了查尔特勒修士的生活方式)进行处理：尸体穿好衣服，带上念珠，放到一块木板上，并钉上衣服与风帽。做完庄严的弥撒后，修道院的修士都戴着风帽，在钟声的陪随下走向墓地。尸体同木板一起下到墓穴，直接与土接触，尽可能让头朝向教堂。主祭先铲入一铲土，然后杂务修士与仆役把坑填实，同时神父们则在边上咏唱圣诗。一根简单的黒木十字架标志着墓穴的位置。
现在小教堂用于数码说明，以及介绍如何使用壁画小教堂的说明。
